Az autoimmun betegségek csoportjában közös, hogy gyakorlatilag az immunrendszer valamilyen ok miatt idegenként azonosítja a saját sejtjeinket, és - működésének megfelelően - megtámadja, elpuszítja azokat. Erre a legismertebb példa talán az 1-es típusú cukorbetegség, amikor az autoimmun folyamat következtében a hasnyálmirigy inzulint termelő sejtcsoportjai, a Langerhans-szigetek pusztulnak el. Okai rendkívül sokfélék lehetnek, a veleszületett genetikai okoktól a lelki problémákig terjednek, de tüneteik között viszont általános a gyulladás.